夜幕下的海天市一切都显得很平静，可是此时正有一桩罪恶而疯狂的事正在酝酿着。
张生强——海天市刑警队队长接到报案说，有人正在陶家镇水泥厂进行毒品交易就带着两名队员前去调查，与此同时张生强的妻子(径侦队副队长)李蔷，却突然接到一个陌生人打来的电话，告诉他张生强有危险，她赶紧通知张生强要小心可是为时以晚，两个置高点上，两个枪手同时向张生强开枪，张生强倒在学泊中。
段逸飞海天市刑警队成员，张生强的得力干将，在公安大学读完博士，回到海天市，刚下飞机就得到张生强遇害的消息，赶紧赶到现场，此时公安局李局长正在现场等着他，并向他简单介绍了情况，李蔷此时也赶来看到满身是血的张生强，当场昏倒不醒人生。
公安局连夜召开紧急会议成立专案组，并人命段逸飞接替刑警队队长职务，限期破案。
经过对现场的调查取证得到一条重要的线索，在案前一天，有两个人开着一辆黑色奥迪车在现场逗留了很久，可是这两个人的长相和车牌号码却不清楚。
段逸飞来到即熟悉又陌生的队长办室，看着张生强留下的遗物不仅黯然神伤，他打开了旧上的笔记本电脑，一个熟悉的名字，引起了他的注意 ——钱金山，可是这个人以死了四年并早以结案的人为什么张生强又把他翻出来呢?段逸飞陷入长长的思考中，究竟是谁敢胆大包天暗杀刑警队队长，死了的钱金山又和此事有什么关系，临危受命的段逸飞怎样去解开这重重迷案……
暗流分集介绍 第二集段逸飞在张生强的电脑里发现了钱金山的案子，可是这个在四年前就以经了结的案子，张生强为什么又把它翻出来，另段逸飞隐约感到了这里边有问题，而且在张生强的笔记本中多次提到“茂才”两个字，这两个字代表什么呢?他带着疑问来到了公安局的户籍科进行调料。
胡田贵来见市委秘书长林源，途中遇到了杜维东面对这个自己以前的手下如今却成了市里的名人，胡田贵不愿过多理采，杜维东对胡田贵却还是很尊重，林源问起对袭警案了解多少胡田贵表示自己也不清楚，而且由于局势紧张，想暂停一些业务这一点和林源的想法，不谋而和。
马局组织刑警队对袭警案的调查进行汇总，会上段逸飞拿出了张生强的笔记本并提到对“茂才”的怀疑马局最后提出两点一是现场的黑色奥迪车，二是全力搞清“茂才”是怎么回事，李蔷在门外听到了这一切。
林嘉琪来到经侦队提出对昌达资源再生公司的怀疑希望经侦队能介入进行调查，李蔷同意了，林嘉琪走出公安局时与段逸飞擦肩而过。
李蔷来到工商局拿走了关于全市叫“茂才”的公司的资料又来到车辆管理所调查黑色奥迪车的事，可得到的答复却是她想问的那个车牌号是不存在的。
康一平来到嘉琪家，想从林源嘴里了解点段逸飞的情况，林源敷衍说自己也不熟。
段逸悄得知张生强牺牲前曾到过昌达物资公司就前来调查，可郑媛媛却说没见过这个人，并说当天公司正在进货另段逸一无所获。
公安局所有的人都对段逸飞抓着四年前钱金山案子不放不能理解，可会上段逸飞却以自己对张生强的了解和诸多疑点提出反问，并把两案进行连系，会后马局告诉他自己同意段逸飞判断并支持他继续做下去，另段逸飞很欣慰。
暗流分集介绍 第三集林嘉琪约见了段逸飞，两个人多年前因为诸多原因没有走到一起而且几年没见面的恋人坐在一起都彼此压抑着自己的情感，段逸飞问林嘉琪当然告诉他只要自己懂得了责任，懂得了成熟，他们就有美好的未来，可为什么自己什么都懂了，他们的未来却不在了?一句话令林嘉琪倒在倒在怀里痛哭失声，这一切都被躲在暗地的康一平看在眼里。
李蔷在张生强的衣服中发现了一张汇着重要线索的纸条想去调查，可闹闹没有人看好求杜维东帮忙，杜维东让自己的女儿安娜去了，李蔷来到纸条上的地址寻打线过却被一名黑衣人打昏，正赶这时段逸飞来到李蔷家看她，见只有安娜和闹闹在很纳闷，这时来了个电话告诉李蔷出事了，段逸飞感到事情严重赶紧赶去现场，等了到时李蔷已经醒了，段逸飞因为李蔷有线索不汇报私自行动和李蔷发生了争执。
杜维东来到孙杰的资源再生公司表示了对他们公司很感性趣并提出想见钱金山的想法，可孙杰矢口否认自己认识钱金山可他的狡别另杜维东更加坚信，钱金山还活着。
李蔷找到段逸飞坚决要参加专案组，段逸飞没办法只好同意。
胡田贵看着报纸上对杜维东的报道，感到这此杜维东从日本回来是来者不善，并对胡小光说起对丁一虎的不信任。
段逸飞和李蔷来到钱金山的家来找他的家人了解钱金山生前的事，经过调查感到钱铁头母子对钱金山的事并不了解。
杜维东坚定了自己的判断后，准备实施引蛇出洞把钱金山引出来。
段逸飞和李蔷来到税务局进行调查，张生强为什么牺牲前要给税务局打几次电话，可税务局的科长却死不承认。
郑刚和林嘉琪又来到资源再生公司对半年内动用的八千元资金干什么去了，可孙杰还是那些话矢口否认狡别。
面对日益临近的破案期限，段逸飞一愁末展，准备从张生强生前查的案子开始入手。
暗流分集介绍 第四集张槐生兴冲冲的拿着和郑媛媛的结婚照片回来，并商量这以后的美好生活，这时孙杰慌慌张张的来找他，告诉他钱金山的事败露了，二人一早就来找已化名为老道的钱金山并告诉了他事情的始未，经老道分析，这一切都是杜维东假借，张生强的案子，想把他引出来，但是是出于什么目的还不清楚，当得知林嘉琪对资金问题穷追不舍时吩咐孙杰对林嘉琪稍稍进行下警告。
林嘉琪和康一平吃完饭正在海力公园散步突然从后边驶来一辆摩托车，将林嘉琪打昏，康一平赶紧给林嘉琪送进医院并对林嘉琪，父母慌称，林嘉琪要出差出天。
经过对税务局的事员的再次审查，确定了茂才物资公司存在的部分问题，这时华子突然告知林嘉琪被袭一事，段逸飞匆匆赶到医院看望，看到有康一平细心的照料，林嘉琪没什么大碍，段逸飞只得离开，医院的走廊里，段逸飞告诉康一平，他和林嘉琪的事已经结不了，现在只是因工作才重新接触的，他的话另康一平了却了一块心病。
下班的路上，段逸飞和马避长提出张生强的案子可能与经济犯法案有关，所以想着重调查茂才公司马局同意。
林源夫妇得知女儿被袭赶到医院看望，得知林嘉琪正在调查一起经济案而和公安局有接触，林源很不高兴。
胡田贵来找老道指责他不应该杀掉张生强，并告诉他注意段逸飞，可是老道更感性趣的是杜维东，胡田贵告诉他，杜维东的目的还不清楚，最好还是先不要碰他。
段逸飞在医院门口碰到了林源夫妇，林源以一位长者的身份告诉段逸飞还是不要和林嘉琪来往了。
安娜把段逸飞请到自己家吃饭，李蔷和闹闹也在，杜维东向段逸飞了解张生强案子的进展，饭后安娜送段逸飞，安娜的妈妈问起了段逸飞的为人，他很担心安娜和段逸飞的过近。
刑警队和经侦队同时行动时，昌达物资公司的张槐生，和茂才资源再生公司的孙杰进行调查，老道的左膀右臂同时被公安调查，他该采取什么行动……
暗流分集介绍 第五集调讯室里张槐生是执死抵赖，可是他的话却和女朋友郑媛媛对不上号，别张槐生慌了手脚。
公安的矛头直指老道，别他坐不住了，只好来找胡田贵，他的到来另胡田贵很紧张，赶紧问他有什么事，原来老道是因为公安对自己查的太紧是来求胡田贵想办法阻止，公安局再查茂才和昌达公司的，胡田贵本不想帮忙，可是一直以来老道的钱都是经胡田贵的地下线庄洗到境外的，其实他们是一根绳上的蚂蟀，为了保全自己他只好去找自己的后台老板。
林嘉琪问康一平对下执行违规操作给茂才贷款的事怎么看，康一平担心林嘉琪的安全，只好以案子已经交给纪侦队了，为借口，不想让林嘉琪继续查下去，可是林嘉琪却不死心，康一平没办法只好答应。林源找来马局长因为公安局扣压张槐生大为恼火说公安局放这袭警案不查，反而盯着纳税大户出口退税的事，李局说张槐生案可能与袭警案有联系，林源却不以为然，让李局马上放人。
李局回去传达了市委领导的意见，令刑警队和经侦队很不服气，段逸飞没办法只好放走张槐生，李蔷告诉张槐生不把他再抓回来这身警服就不穿了，张槐生趾高气昂的走了。
张槐生回到家，郑媛媛劝他还是和老道他们在一起了，其实张槐生想脱离他们，只好连夜去找老道，自从张槐生离开公安局，李蔷就开始偷偷的跟着他，李蔷跟踪张槐生来到一块荒地时张槐生下车，李蔷也跟下车。却被跟在后边的孙杰打昏，这时突然上来一黑衣人将耿杰打跑求了李蔷。
李杰来到别墅将李蔷跟踪张槐生的事告诉了老道，老道赶紧离开，老道走后，张槐生和胡田贵说象老道这样总和警察作对早晚出事，应该从新组织一个团队，胡田贵告诉他要沉住气。
黑衣人将李蔷送到家楼下并给段逸飞发了信息段逸飞赶紧到李蔷家并在车里找到了昏迷的李蔷。
杜维东回到自己的办公室偷偷的处理自己的伤口。
林嘉琪来到公安局了解案子的进展可郑刚告诉她李局已明确表示案子暂停，林嘉琪遇到了段逸飞问他怎么想并说如果公安局不查她就自己查下去。
暗流分集介绍 第六集由于香港廉政公署的介入另老道的资金没法从胡田贵的渠道走出去，胡田贵准备将老道的钱退给他。
经查实，茂才公司和昌达公司的法人代表都是张槐生黑夜段逸飞偷偷的来找证据，李蔷这时也偷偷的跟来，可是他们却被保安发现，只好逃走。
经过对案件的汇总，得出一个结论是张生强对茂才的调查，逼上逼近了幕后的黑手，所以他们才铤而走险杀害了张生强，李局最后指示将茂才公司和昌达公司并案调查，但要暗中调查。
孙杰被着杜维东将杜玲玲接到了别墅，杜维东得知后匆匆赶来将妹妹接走。
张槐生由于警察的调查越来越紧，准备脱离老道他找到胡田贵，并表示要一起合作，胡田贵欣然同意，张槐生还告诉胡田贵，杜维东已经开始和老道合作了。
老道找来了杜维东，想谈合作的事，可杜维东却告诉他，老道一直做的都是风口渡尘的事，不如和自己做正当生意，老道问是什么生意，杜维东说“投资办银行”并对国内外的金融行势和老道的背景和身价进行了分析，老道答应合作，但有个条件是先把自己的两仟万弄到境外去借机试探一下杜维东的能力，杜维东同意。
杜维东心情不错，自己下橱给安娜娘俩做席间，安娜又提起段逸飞，另她妈妈很担心可是杜维东却认为没什么。
张槐生找来孙杰，表示了对老道的不满并劝说孙杰和自己一同退出令投靠山，孙杰同意了，二人并商量如何行动。
暗流分集介绍 第七集孙杰和张槐生来到了老道的别墅，表示了对和杜维系合作的担心，不如由自己想办法把钱运出去，老道问孙杰怎么想孙杰认为张槐生说的对，老道将钱拿出，张槐生示意孙杰动手，可是孙杰却突然调转枪口将张槐生打死。
张槐生的突然亡另公安局措手不及，赶紧对孙杰进行抓捕，可是孙杰已经跑了。
康一平因为担心林嘉琪的危险，又一次劝说林嘉琪不要在调查下去，却遭到林嘉琪的烦感。
杜维东很顺利的把老道的钱转到境外与此同时胡田贵又来到老道这表示了担心，老道告诉他其实自己还是信任胡田贵的，如果自己不行了，就把钱转到儿子钱头名下，由胡田贵继续操作和杜维东周旋。
晚上回家的郑媛媛突然遭到蒙面人的袭击。医院里郑媛媛向段逸飞交待了张槐生和孙杰后面还有个人，她只知道叫道哥，有了证据，公安局迅速对和茂才安有关的人进行抓捕。
杜维东意识到老道这次是在劫难逃了的下场。
康一平苦苦的等着林嘉琪吃饭呆是林嘉琪此时正和段逸飞在一起，段逸飞也不想让她再调查下去，林嘉琪不语。
段逸飞经过再一次对郑媛媛的审问终于得知老道藏身在海上别墅，就化妆成水管的想法探个虚实，可是钱金山早就认出了他，几年前的仇人又一次面对面的坐在了一起，老道告诉他既使段逸不来自己也要去找他就是因为张生强的穷追不舍，所以才杀了他，并把段逸飞打昏藏在了逃跑的车后箱里，作为人质。
刑警队长的失踪令公安局引起了轩然大波并全力录找老道来到杜维东的办公室，杜维东告诉他想要的东西已经办完还给老道在日本安排了住处。
林嘉琪得知段逸飞失踪好几天顿时慌了手脚。
暗流分集介绍 第八集老道临走前回到了自己以经几年没回过的家里看了看并告诉儿子铁头，等自己逃出去后就把他们母女也想办法弄出去。
李蔷等刑警队员从郑媛媛口中得知段逸飞失踪前在她这得知了老道的藏身地别墅，就赶紧赶到别墅去看这个究竟，可是别墅里以人去楼空，正在一愁未展时，林嘉琪却无意中发现了，段逸飞故意掉到现场的小猪项链，这是林嘉琪和段逸飞的定情信物，由此可断定，段逸飞就是从这里失踪的，担心父亲危险的钱头按耐不住给钱金山打了电话，却被公安局追踪信号而得知了钱金山身在何处，赶紧在他们逃路的设卡堵截。李蔷等刑警队员一路追踪老道来到码头，展开激烈枪战，跟随而来的林嘉琪在枪战中受伤，孙杰被刑察击毙，铁头突然冲出来分散了老道的注意，段逸飞使出全力踢了老道一脚，并迅速卧倒就在这电光的瞬间，李蔷等开枪将老道击毙。
罪恶深重的老道死了，张生强的大仇终于得报李蔷面向大海，泪流满面，在心里默默告慰张生强的在天之灵。
老道的死讯传到了杜维东和胡田贵的耳中，二人迅速做出了反应，停止了一切同老道生前有关的连的项目，胡田贵还派人从看守所里保出了郑媛媛。
在公安系统表彰大会上，林源带代市里给予参加此案的干警分别进行了嘉奖，可是唯独没有李蔷。
暗流分集介绍 第九集胡恍深夜来找郑媛媛家，劝说她到自己公司来做会计，这样对死去的张槐生也有个交代其实胡恍等人是想把郑媛媛监视起来。
段逸飞并不认为钱金山一死就代表所有的案件就了结了，他来到看守所想找郑媛媛再聊聊，可是到了以后才知道郑媛媛已经被保释了。
段逸飞和李蔷在去钱金山家的途中正碰到胡田贵也去钱金山家，段逸飞对钱铁头母子进行了讯问可是，钱铁头却一口否认认识胡田贵其人另段逸飞拿他没撤。
在胡田贵的组织下，市里几家大企业的老总对公安局能破获钱金山案，保护了一方平安，对公安局表示感谢，并赠送了锦旗，李局长非常明白他们这么做的原因其实是想为自己开脱，就故意试探胡田贵说参加酒会的几位老总，有涉嫌钱金山一案的嫌疑另胡田贵很紧张。
由于自己的路线被阻，李岚又受幕后老板指使前来催促赶紧把钱弄出去，胡田贵没办法想起了从海外回来的杜维东，可是他不知道杜维东从日本回来其实就是冲他来的。胡田贵说出了想和杜维东合作的想法，杜维东也告诉了他的计划，希望胡田贵加入自己收购日本东亚银行30%股权的计划，这样胡田贵就可以从一个地下钱庄的幕后老板走到前台大大方方的做银行家了，胡田贵对杜维东的家底一清二楚，他知道杜维东肯定把老道的钱也算在了自己的名下，合作不是不可能但先把老道的钱洗到境外给他看看，杜维东心有成竹的答应了。
暗流分集介绍 第十集康一平明知故问的问林嘉琪昨天干什么去了，林嘉琪直言不讳的告诉他去公安局了，康一平很不高兴，林嘉琪却说他小心眼。
老道的残余份子，都来投靠下虎，并一致推举下一虎为大哥。
林嘉琪回到家里，父母对他又去公安局非常生气，林嘉琪与父母发生争吵。
钱金山死后，段逸飞并不让为案件就些结束了，比如他的钱哪去了，他为什么要杀张槐生，可他的关点并不是所有的人都赞同，最后李局指示查还是要查，但不要生张。
郑媛媛的失踪另胡田贵很紧张，吩咐胡小光尽快找到她。
李蔷跟踪罗丁香的黄件来到她的菜庄，却被罗丁香发现，并偷偷的拍了照片，晚上她赶紧组织手下人把没在聚庄的地下钱庄搬走。
杜维东很顺利的把胡田贵的第一笔资金转出去并把支票还给了胡小光，当然，相应的胡小光也给了杜维东一笔可观的报筹，可是杜维东为了谋长长远的合作，和诚意，又把钱不定期给了胡小光。
段逸飞苦于罗丁香和胡田贵到底是什么关系搞不清楚，所以想找个人打入胡田贵内部，李蔷问他想让谁去，段逸飞说最合适的人选是郑媛媛，李蔷很不理解因为郑媛媛在那都不清楚段逸飞却告诉她跟踪罗丁香就可以。
胡田贵把一分收购东亚银行的策化书交给了李岚还给了她一部贵重的礼物和一张支票，想让李岚在幕后老板林源前美言几句，李岚欣然答应了。
胡田贵收到一个陌生人的约请，晚上他来赶约没想到是苦苦寻找的郑媛媛，郑媛媛拿相逼问他张槐生的死和他有没有关系，胡田贵告诉他张槐生的死他很痛心，是因为张槐生对老道有了二心所以老道才杀了他。
专案组的所有成员在罗丁香的茶庄蹲守，由李蔷假意买茶叶去查探虚实，可是应进入搜察时却什么都没发现。
段逸飞因为李蔷私自行动而打草惊蛇，很生气，让李蔷休息。
林嘉琪来找段逸飞想和他说碰到郑媛媛的事却被李蔷误认为是找段逸飞谈情说爱，故意说段逸飞不在把她支走，段逸飞知道后是哭笑不得。
胡田贵想把郑媛媛安排在总公司这样即可以监视她又可以考验她，可是胡小光却担心她会了解更多。
由于东亚银行的竟标日期越来越近，杜维东又催胡田贵把资金打入帐户，可是胡田贵并不完全相信杜维东，他吩咐胡小光去日本打探一下虚实。
暗流分集剧情 第十一集林嘉琪来到胡田贵的均祥集团抽查帐目，却无竟中看到了郑媛媛这才得知原来她是均祥的财物总监，林嘉琪想以资金出入不队为借口，想和郑媛媛聊聊，可是胡田贵叫进来的却是一个男的，她赶紧把这件事告诉了段逸飞并把段逸飞故意掉到了老道别墅的的那个小瓷猪还给了他。
李蔷然对罗丁香手下的两个小黄牛紧追不，罗丁香给了他们俩一笔钱让他们离开本市，可是晚上，那两名小黄牛却离奇的死了。
杜维东得知胡小光去日本暗中调查却一点也不紧张因为他早都想到了胡田贵会来这一手，不久胡小光从日本带回来两名金融专家。
闹闹放学时被罗丁香的手下绑架，李蔷到处找不到闹闹乱了方寸，赶紧找来段逸飞一起帮她寻找，晚上闹闹趁看守睡着，偷偷的跑回来，在闹闹的指认下刑警队一举抓获了罗丁香的手下并收缴了大量还没转出去的现金。
杜维东给胡田贵打电话，问闹闹是不是他们绑架的，胡田贵赶紧询问丁一虎，在得知是罗丁香所为时，很生气，认为这个老人早晚要坏事，让下一虎看着办。
经过对罗丁香手下的审问得知了罗丁香的住处，段逸飞等赶去抓紧捕可到了以后才发现罗丁香已经死了。
暗流分集剧情 第十二集胡小光又来劝说胡田贵和杜维东合作，胡田贵却还是不十分放心，约杜维东第二天，再谈谈，可是与此同时胡小光从日本带回来两名日本专家，正在胡田贵公司坐客，原来他们和杜维东早都认识而且这些胡小光能从日本找到他们也是杜维东精心安排的。
林嘉琪又来到均祥集团找郑媛媛，可是却被胡小光发现，胡小光第二天找郑媛媛了解况，得知林嘉琪是来了解张槐生案件时，才放心的让她走了。
安娜很不客气的堵住林嘉琪并当着康一平的面指责她，脚踩两条船，另林嘉琪很生气她来找段逸飞希望他和安娜解释清楚，并告诉他从郑媛媛口中得知在罗丁香手下被杀的同一天，罗丁香给丁一虎汇过五十万。
杜维东无意中从李蔷口中得知胡田贵身边有个警方的卧底赶紧跑来告诉胡田贵，分析来分析去胡田贵认为这个人只可能是郑媛媛，胡田贵终于决定同杜维东合作可是手头资金不够他让胡小光告诉所有的手下的二级钱庄要大量发展客户有多少发展多少，同时吩咐胡小光关照一下郑媛媛。
丁一虎来找杜维东说胡田贵想让他把郑媛媛杀掉，问杜维东怎么想，杜维东找到胡田贵告诉他不到迫不得以，不要用极端手段，不如把她安排到自己老婆的美面院去这样她即不能了解更多事情，还能看着她，胡田贵同意了。
杜维东找到郑媛媛告诉他，胡田贵已经知道了她在暗中调查并想除掉她，段逸飞也只是把她当成了一颗破案的棋子，只有在自己身边她才是安全的。
晚上林嘉琪又来找郑媛媛可是郑媛媛的态度却来了个一百八十度大转弯，另林嘉琪很失望。
李蔷得知郑媛媛跑到美容院去当会计了就去问杜维东怎么回事，杜维东却推说对些事不清楚反过来又和李蔷说，如果她真和案件有关在他这正好可以看着她，另李蔷打消了顾虑。
暗流分集剧情 第十三集杜维东得知段逸飞找过郑媛媛就假借关心工作为重想了解一下，可是郑媛媛告诉他原本以为在他这工作可以让自己忘记过去，可是她作不到，所以她想和警方合作把她手上的证据交给警方，杜维东赶紧把此事告诉了胡田贵。
由于外国CE集团也要收购东亚银行，杜维东找到胡田贵商讨此事，并希望胡田贵能再多筹集些钱，可是胡田贵却和他算起了利益分配的事，别胡田贵心里很不放心。
胡田贵约林源和银行的赵行长吃饭，席间得知康一平和林嘉琪要去日本调查非法帐户的事，胡田贵假借去卫生间赶紧通知了杜维东这让杜维东很紧张。
杜嘉琪坐着爸爸的车来找郑媛媛，让郑媛媛很紧张，本来她是想把掌握的资料交给林嘉琪的，可是得知林嘉琪和林源的关系后她借口去卫生间将资料发给了一个叫“懒得理你”的网友，却给了林嘉琪一个空的U盘。
晚上郑媛媛正在和“懒得理你”聊天一个黑影偷偷的摸到她家将郑媛媛勒死。
林嘉琪回到办公室发现U盘是空的赶紧来找段逸飞。
暗流分集剧情 第十四集林嘉琪在等段逸飞时，康一平也来打林嘉琪、段逸飞赶到时发现U盘是空的，怀疑是林嘉琪和康一平操作上的失误，将里边的东西删除了，因此和二人发生了口角。
正在段逸飞一愁末展的时却得到了郑媛媛被杀的消息，段逸飞赶紧赶到现场发现了一张，林源、张槐生和胡田贵的照片。
段逸飞为自己不问是非就和林嘉琪发火和她道了歉他意识到可能是郑媛媛发现了什么所以才把一个空的U盘给了林嘉琪，郑媛媛的死，对林嘉琪触动也很大，她把郑媛媛死的事告诉了林源。
段逸飞来到美容院调查郑嫒嫒在这个工作时表现可是杜维东早就告诉妻子如果公案来调查就说郑媛媛有忧郁症，把警方的调查引入歧途。
下一虎从郑媛媛爱拿到了她的电脑并把它交给了杜维东可是杜维东发现电脑里也是什么都没有这另他大为恼火。
美国CG公司把日本东亚银行的标价提高到九个仇面对两个亿的缺口，杜维东来找胡田贵，可是胡田贵却再也不想往里投入了这另杜维东也拿他没办法。
胡田贵因为在报纸上发表了一篇关于郑媛媛之死的文章另胡田贵很被动所以他约出李岚想让她再写篇文章将此事遮盖过去。
杜维东想利用女儿和段逸飞的关系从公安局套出点内部消息，可是妻子并不想让安娜和段逸飞走得过近硬把安娜逼回日本。
暗流分集剧情 第十五集杜维东因为资金的问题，又来找胡田贵商量，可是胡田贵的态度却大不如前，杜维东没办法告诉了胡田贵公安局限性关郑媛媛家里找到了他和张槐生、林源的照片，胡田贵表面振静却赶紧找来李岚让她想办法，因为照片是李岚拍的，李岚拿着照片和底片来到公安局，另所有的办案刑警很无耐，林源又特意打电话给李局解释了照片的来由，这让段逸飞很生气。
林嘉琪突然想起郑媛媛生前和她说过老家还有人想和段逸飞去了解一下，可是此时康一平却突然找到她和她谈分手的事，另林嘉琪无言以对。
段逸飞来到郑媛媛家想要拿回郑媛媛绵电脑可是郑媛媛妈妈却告诉电脑昨天已经给了警察。
段逸飞以郑媛媛的名义在网上聊天得知郑媛媛死前和一个叫“赖得理你”的网友接触过并好像有什么东西放在他那了，可是“赖得理你”要求见面，但郑媛媛以死让准去冒名顶替呢?
林嘉琪打扮成郑媛媛的模样来公安局的路上却无意被丁一虎发现并偷偷的跟踪过来，林嘉琪在公安局用电脑聊天成功的约出“赖得理你”可是见面时林嘉琪露出了破绽“赖得理你”找了个借口逃走，段逸飞等人赶紧去追却发现“赖得理你”已经被杀。
暗流分集剧情 第十六集“赖得理你”的电脑被送到了丁一虎的手里，他赶紧给杜维东打电话通知此事，可是杜维东却让她把电脑里的资料传到公安局去，因为电脑里全是胡小光公司和张槐生的帐目往来，他想以此来威胁胡田贵。
杜维东通过林源的介绍认识了国有企业华晨集团的公司的董事长，周勇，这让杜维东又看到了一丝亮光，他约出林源说服他想用林源的关系让周勇加入林源答应了。
胡田贵因为杜维东北地里又找了一个合作人而使自己利益受损，绝出杜维东商谈，可是杜维东并不把他的态度当回事。
华晨集团的资金流入不正常的另林嘉琪感到不正常就进行了调查，却发生，华晨的资金都打入了一个日本的宏田基金，林嘉琪和康一平决定立刻去日本进行调查，可是临行前却无意间把华晨的资金问题告诉了林源。
杜维东约李蔷来看杜玲玲杜维东给杜玲玲吹起口琴三个人都想起童年往事，黯然泪下。
段逸飞故意告诉杜维东公安局拥有胡小光和张槐生帐目往来的一半帐本，杜维东把此事告诉了胡田贵这让胡田贵吃惊不小。
暗流分集剧情 第十七集李蔷跟踪小黄牛来到胡小光名下的书店却被书店老板杨帆看出赶紧通知了胡小光，对于警察这么快就盯上自己另胡小光很紧张他来找到父亲胡田贵讯说了此事，经胡田贵分析这有可能是杜维东暗中搞的鬼他吩咐胡小光去试探一下杜维东，胡小光命令手下杨帆绑架了杜维东，自己躲在暗中偷听杨帆审问杜维东的对话。
胡小光拙劣的演技早就被杜维东看出来他找到胡田贵兴师问罪，并扬言要把钱奶给胡田贵合作到此结束，经过胡田贵一番解释杜维东也就借坡下驴，一笑而过了。
晚上胡田贵给杜维东压惊，杜维东借这酒劲又说起了资金缺口问题，胡田贵满口答应，杜维东假意喝醉提前离席出了门他给丁一虎打了个电话，让他想办法弄到胡小光的帐本只要弄倒了胡田贵均祥集团就是丁一虎的了，丁一虎想这事只有胡小妹能办就让胡小妹到胡小光的公司去管帐。
李蔷又来到杨帆的书店暗中调查却被杨帆等人打昏并将绑架到丁一虎的仓库，早以得到消息的丁一虎极时赶到并通知了杜维东和胡田贵，杜维东得到消息后，通知了段逸飞救出了李蔷抓捕了杨帆一干人等。
段逸飞对杜维东为什么能知道这么多事很怀疑，就给杜维东打了个电话旁敲侧去的进行了讯问杜维东解释说是因为丁一虎因为财产问题对胡小光有意见，所以才通知自己，杜维东还告诉段逸飞安娜从日本回来了，自己也不反对他们俩个的事，段逸飞一笑而过。
暗流分集剧情 第十八集胡小妹下班途中被人抢劫，并将胡小光公司的帐本一并抢走。杨帆被抓帐本被抢两件事另胡小光紧张万分，胡田贵跟他说有可能是杜维东指使丁一虎干的，让胡小光明天把人都约出来开会顺便摸摸底。
开会时胡小光矛头直指丁一虎和杜维东还发生了争吵，杜维东告诉胡小光如果想动李蔷得先过他这关还劝大家既然是合作就要精诚团结，会后杜维东吩咐丁一虎把胡小光公司的资料传给公安局。
段逸飞、李蔷又对杨帆进行了提审可是杨帆却突然中毒身亡，另刚有点起色的案件线索又断了。李蔷突然接到一封网上的匿名由件打开后，才发现原来是胡小光公司的帐目他赶紧通知了段逸飞公安局迅速行动对胡小光进行抓捕。
胡田贵得知自己儿子被抓非常着急赶紧约出后台老板林源商讨怎么办，林源却问他要儿子还是要事业，胡田贵想鱼死网破林源坚决不同意为了保全自己，林源让胡田贵把儿子先舍去。
利用胡小光公司的帐目，顺藤摸瓜公安局查抄了一批涉嫌洗钱的地下钱庄和公司，在金市引起了重大的反响，市委还特意给予嘉奖。
丁一虎来看望胡小光，并告诉他这一切都是他作的，下一虎还告诉胡小光要把胡小光公司的帐目都转移到胡田贵的公司，另胡小光心脏病突发，医护人员赶紧给胡小光喂下一虎刚送来的药，可是药却是假的胡小光病发身亡。
暗流分集剧情 第十九集胡小光的死讯传到了胡田贵那里，老年丧子胡田贵再也支持不住了，林源来看望胡田贵并带来了康市长的问候，可是胡田贵跟本不想理他，林源走后，他问起胡小妹，去看守所的经过和为什么去不光公司的事得知都是丁一虎安排的。
胡小光集团被瓦解后段逸飞并不认为案件就此就了结了他来到胡小光的灵堂找胡田贵告诉胡田贵胡小光的死有诸多疑点希望胡田贵说出胡小光背后的人，胡田贵告诉他胡小光背后的人就的自己。
段逸飞来找胡田贵，另林源很紧张他携同杜维东来找胡田贵，一进门就因为胡田贵大排灵堂很不高兴，可是胡田贵也指责林源在胡小光死的事上没有尽力，林源却告诉他要不是自己人和介入公安局早就对他进行调查了，杜维东在中间调结说，大家是为一个共同的目的是一个利益共同体越到这个时候越应该团结。
林源找来李局以郑嫒嫒的死和胡小光的死刑警队办案不利为理停了段逸飞的职，李局却一想这正好可以让段逸飞避避风头，段逸飞欣然接受并把队长一职受于李蔷，可是刑警队里大家并没有因为段逸飞被停职而气馁，大家达成同识暗地里还是段逸飞主持工作。
林嘉琪偷偷的监视着周勇的情人，徐秀芬却不想螳螂捕蚕黄雀在后，丁一虎也早就盯上了她。
暗流分集剧情 第二十集下一虎的手下砸了林嘉琪的手，林嘉琪赶紧通知了段逸飞。
周勇和徐秀芬看到了砸车的一幕，周勇认出了林嘉琪就让徐秀芬去试探一下，正在这时康一平来接林嘉琪周勇一看是康一平吃惊不小。
李蔷一路追踪来到胡小光的灵堂找胡田贵这是的胡田贵正在和林源通话，林源在电话里得知林嘉琪车被砸的事，段逸飞及时赶到执止了李蔷的冲动行为，胡田贵逼段逸飞要不告诉他胡小光的死因和背后指使的那个人，就要让段逸飞和李蔷因为今天的事付责任，段逸飞没办法只好妥协林源因为林嘉琪车被砸的事来找胡田光要个说法正好杜维东也在，胡田贵和杜维东不应该让林嘉琪和段逸飞走的过近，林源却指责杜维东也不应该让女儿和段逸飞走的过近，胡田贵一句 “这段逸飞快成人们两家的女婿了”另两人很不高兴。
林源想把林嘉琪调出反洗钱处，可是林嘉琪不同意还指责林源对段逸飞不公平父女俩发生了激烈的争吵。
胡田贵来找香港的一个银行家和他说起日本东亚银行和宏田基金的事，他让这位香港的李先生到日本想想办法，一但收获东亚银行成功操作宏田，基金的人必须是胡田贵。
丁一虎偷拍了一批周勇和徐秀芬的照片来送给杜维东留做将来，威胁周勇的证据，同时他们还谈起胡小光死因的事，安娜假借送水果偷偷把他们对话进行了录音。
暗流分集剧情介绍 第二十一集安娜把录音交给了段逸飞和李蔷听却非让段逸飞亲她一下段逸飞没办法只好亲一下，却被来找他的林嘉琪看见。
康一平担心林嘉琪的安危，同时也想多了解一些华晨集团和洗钱的关系就暗中跟踪徐秀芬，却发现丁一虎将徐秀芬接走，原来丁一虎是受胡田贵指使途中他把这事通知了杜维系，杜维东来到均祥集团很不客气的又把徐秀芬带走，另胡田贵火冒三丈。
由于合作，团队最近内部矛盾不段，所以胡田贵、林源、杜维东又坐到了一起想聊一下，可是谈话还没开始，杜维东和胡田贵就又发生了争执，林源从中调解，胡田贵直言不讳的说，将来要在东亚银行30%的股份中自己要占14%这另林源和杜维东没法接受。
段逸飞告诉胡田贵自己掌握了胡小光死的真正原因如果想知道就要拿出相应的消息做交换，胡田贵想了一宿告诉了段逸飞钱金山死后留下一笔两亿美金的财产现在在杜维东手里用来收购东亚银行，做为交换条件段逸飞告诉胡田贵，胡小光死前吃的药是假的。
段逸飞和李蔷到钱铁头家了解情况在回来的路上，遭到丁一虎等人伏击，李局得到通知带领大批警察前来迎救。段逸飞突然意识到钱金头母子可能有危险赶紧反回去可到时钱铁头家已是人去屋空。
暗流分集剧情介绍 第二十二集杜维东给林源打电话告诉他胡田贵准备撤出想让林源跟他聊聊，可是林源对他的态度却是不冷不热，紧接着电话就再也打不通了，丁一虎这时来找他，杜维东因为他们伏击段逸飞和李蔷很生气，并吩咐他一定想办法找到钱铁头。
林嘉琪又来找徐秀芬想让她解释一下帮助华晨集团转帐的事，徐秀芬解释说是日本宏田株式会社在日本代理着华晨的产品，这笔钱只是补给华晨的差价，林嘉琪一听其实就是在洗钱，就来找康一平希望对华晨的帐目进行调查，可是康一平早就得到林源的指示，对华晨的事要大事化了，所以他不同意，另林嘉琪非常失望。
周勇找到杜维东和他说林嘉琪又去找过徐秀芬说如果再这样自己快顶不住了，杜维东说最近找不到后台老板林源，如果胡男贵和段逸飞要是联起手来后果会很危险，二人决定来找林源。
此时的林源正和胡田贵在一起，胡田贵告诉林源之所以告诉段逸飞钱金山遗产是想转移警方和视线，现在主要是把周能拉过来这样就可以把杜维东踢出局。
段逸飞突然接到报告诉徐秀芬被杀了赶紧过去通过讯问得知昨天林嘉琪来过这让段逸飞很无耐。
杜维东因为和胡田贵的合作走到了未路没办法他找来李岚想通过她和康市长的关系说服林源断续四到合作轩队中来要不然就通过李岚的关系和康市长的影响从新寻找合作伙伴。
暗流分集剧情介绍 第二十三集徐秀芬的空然死亡另林源很紧张，他来找胡田贵寻问，事情和胡田贵有没有关系，可胡田贵对引事并不知情。
经过勘查徐秀芬的死并不是自杀这此收李局亲自挂帅来调查并同时恢复了段逸飞刑警队队长的职务。会议决定并案侦察一定要把案子破了。
胡田贵和林源画到杜维东的办公室给了他两条路一是回日本，二如果以后断续合作要由胡田贵作主，所有的矛头都有指向了杜维东所有的人都对他有意见，杜维东只好答应回日本。
段逸飞等人来抓捕丁一虎，却捕了个空，此时的丁一虎正等在胡田贵家门口拿着抢准备对胡田贵下手可是面对自己的老丈人和自己的妻子他没下去手，胡田贵思来想去不能让丁一虎落八警察手里而且也是为了胡小妹所以他又找到杜维东让他把丁一虎弄到国外去这是断续合作的条件。
杜维东来到丁一虎的藏身处劝说他只要弄死胡田贵均祥集团就是他的了，可是丁一虎，下不去手。
胡田贵来找杜维东道别却突然接到电话自己手下的好几个子公司都被公安局查封了。他赶紧赶回去处理，杜维东却打来电话说原本自己想回日本的看来，胡田贵更着急就把船票先让给他吧!还告诉他不用去找林源了一般在这种情况下林源都会躲起来的”，杜维东说的没错，林源已从李岚口中得到了康市长的指示不要在胡田贵身上断续下功夫了，当前的任务是保住华晨集团。
暗流分集剧情介绍 第二十四集随着调查的深入林源坐不住了他找来李局长吩咐他市里要成立专案组对华晨集进行调查所以公安局就先不要查了，李局把市里的态度告诉了段逸飞并命令他全力调查胡田贵一有线索立即抓捕。
胡田贵知道自己大势已去准备逃走，大码头丁一虎悄悄的把抢顶在了他头上，胡田贵告诉他自己知道在劫难逃叮嘱丁一虎着顾好胡小妹，丁一牙面对自己的老丈人又一次手软了，突然杜维东派来的杀手赶到丁一虎救出胡田贵逃走。
胡田贵逃出来后，知道自己难逃法网他约出了，段逸飞告诉了他整个事情的来龙去脉和林源,杜维东等在此事中充当的角色,段逸飞答应他现在不抓他可以回家着看女儿.
丁一虎终于明白自己其实一直被杜维东利用就想找个机会干掉他，可是却一直没有找来合适的时机。
康一平从日本回平找到了林源和他详细进了华晨集团的所有违法行为。林源却告诉了他康市长其实就是整个事件中最大的幕后黑手另康一平痛苦不已他又来找李岚算帐正在此时康市长也来找李岚康一平躲在暗处听到了父亲和李岚的谈话万念俱灰。
林嘉琪回到家里林源劝说她和康一平出国，被林嘉琪误认为是康一平的注意，另她很生气。
段逸飞等人按胡田贵提供的线索和证据对杜维东的公司进行了查封，可是杜维东却早已溜走李蔷分析着杜维东有可能去的地方到处寻找。
暗流分集剧情介绍 第二十五集(大结局)林嘉琪早上来上班就被赵行长找去告诉了她康一平自杀了，并将康一平的遗书义给了一林嘉琪，收到一份快递，原来是康一平自杀前给自己邮的里面全是他从日本调查而得到的华晨集团的违法证据。看看康一平的遗书想起了康一平的音容笑貌让林嘉琪痛哭流啼。
公安局里干警们正苦于证据不足设法对华晨集团调查时林嘉琪急时的出现把康一平调查的材料交给了他们，李局报告了市党委准备对。林源康市长，周勇。杜维东。胡田贵，等进行抓捕，市里给予批准。
李蔷赶到福利院，希望可以找到杜维东却发现，杜玲玲已被杜维东先到一步给毒死了。
丁一虎看没有 机会对杜维东下手就却持了安娜而把杜维东引出来，正在他准备向杜维东捅下杀手时李蔷及时赶到丁一虎受伤逃走。
杜维东却突然捡起了李蔷掉在地上的平抢将抢口对准了她，李蔷非常痛苦的责问杜维东为什么要这么干为什么要杀死那么多人，杜维东却诉说了自己的不干，心高气傲的杜维东想自杀段逸飞赶到劝他缴械投降，并告诉他不要把自己看得太高其实他和胡田贵等人一样，安娜跪下求父亲，杜维东伸出了手，李蔷含泪给他带上了手铐。
这股地下暗流终于被堵截，所有犯罪嫌疑人都已绳之以法，段逸飞手捧一束鲜花来到灵园祭奠张生强。(全剧终)
